1973年以来，他在中国科学院生物物理所与合作者经过二十年长期艰苦攻关，发表论文110篇。写成专著《针灸经络生物物理学-中国第一大发明的科学验证》（北京出版社，1989）。他们运用电子学、生物化学、生物物理、声学和形态及动植物等多种学科检测和独特的实验法，准确地揭示人体经络线的分布位置，证实了古典经络图谱的高度科学性和客观存在。以后又提出“经络是多层次、多功能、多形态立体结构的调控系统”的理论。这一研究成果运用于临床之中，取得神奇效果。因此获得国家科委首届“星火杯”创造发明特等奖。此外还10次荣获国家卫生部、市科委等科学进步奖。

　　祝总骧现在是中国科学院生物物理所主任教授、中国管理科学院终身教授，并被美国国际针灸医学院聘为教授。他先后几十次出国访问，10次被授予荣誉勋章、会员、科学博士、教授、顾问等称号。

 　　祝教授根据经络学说提出了“312经络百岁健身法”，现已被国家体育总局推荐为科学健身法。国内外已有上千万人应用这一方法进行自我医疗保健，取得优异效果。

　　2008年11月，首届“中华原创医学复兴论坛”在京召开，论坛的主题是“重铸中华医魂”。祝总骧先生作为演讲嘉宾参加了本论坛，演讲题目是《312经络锻炼法与人类健康》。 

　　主要事迹

      ★中国科学院生物物理研究所终身教授
 　  ★首次科学实验证明人体经络存在的世界级经络学家
　　★北京炎黄经络研究中心主任
　　★被美国、英国、法国等十余国授予勋章、院士、博士、教授、顾问等称号
 　  ★国家首届“星火杯”创造发明特等奖获得者
 　  ★其首创的“312”经络锻炼法全球受益人群超过3000万人，遍及数十个国家
　　★“312”经络锻炼法被国家体育总局推荐为科学健身法
　　★欧盟连续11年派遣代表团来华学习“312”经络锻炼法
　　★中央电视台、中央人民广播电台、《人民日报》、《世界日报》等海内外权威媒体持续关注近20载。